Seit der Hauptversammlung vom 28. Januar 2008 führt ein Vorstand aus drei Mitgliedern die Wincor Nixdorf AG: Vorstandsvorsitzender Eckard Heidloff sowie die beiden Vorstandsmitglieder Stefan Auerbach und Dr. Jürgen Wunram.

Der Vorstand leitet die Aktiengesellschaft in eigener Verantwortung. Ihre Geschäfte führt er nach gesetzlichen Vorschriften, dem Deutschen Corporate Governance (Glossar)  Kodex, der Satzung der Wincor Nixdorf AG und der Geschäftsordnung für den Vorstand. Ziel aller Vorstandsentscheidungen und -handlungen ist es, die Interessen des Unternehmens zu wahren. Beschlüsse fasst der Vorstand grundsätzlich mit einfacher Mehrheit. Kommt es - wie zum Beispiel, wenn nur zwei Vorstandsmitglieder an der Sitzung teilnehmen oder wenn sich ein Vorstandsmitglied der Stimme enthält - zu einer Stimmengleichheit, zählt die Stimme des Vorstandsvorsitzenden zweifach.

Die strategische Ausrichtung der Wincor Nixdorf AG stimmt der Vorstand mit dem Aufsichtsrat ab und setzt sie verantwortlich um. Dabei achtet der Vorstand darauf, dass die im Unternehmen eingesetzten Führungsinstrumente sowohl effektiv als auch effizient sind. Die zwei vorrangigen Ziele von Wincor Nixdorf sind, die Kunden besser als die Mitbewerber zu bedienen und den Wert des Unternehmens nachhaltig zu steigern. Aus diesem Grund nehmen die Planungs-, Kontroll- und Risikomanagementsysteme, mit denen das Unternehmen gesteuert wird, eine bedeutende Stellung in der Unternehmensführung ein.

Regelmäßig, zeitnah und umfassend informiert der Vorstand den Aufsichtsrat über alle wesentlichen Fragen der Planung, Geschäftsentwicklung und Risikosituation. Ebenso werden Abweichungen von der Planung sowie von festgelegten Zielen dem Aufsichtsrat berichtet und ihm gegenüber erläutert.