Die Wincor Nixdorf AG wird von einem vierköpfigen Vorstand geführt. Vorstandsvorsitzender ist Karl-Heinz Stiller. Dem Vorstand gehören zudem Eckard Heidloff (stellv. Vorstandsvorsitzender), Stefan Auerbach und Jürgen Wilde an.

Der Vorstand leitet die Gesellschaft in eigener Verantwortung und führt die Geschäfte nach den gesetzlichen Vorschriften, der Satzung der Wincor Nixdorf AG und der Geschäftsordnung für den Vorstand. Im Mittelpunkt aller Entscheidungen und aller Handlungen steht dabei, die Interessen des Unternehmens zu wahren. Beschlüsse werden grundsätzlich mit einfacher Mehrheit getroffen. Bei Stimmengleichheit zählt die Stimme des Vorstandsvorsitzenden doppelt. Bestimmte Geschäfte, die in der Geschäftsordnung für den Vorstand definiert sind, bedürfen der Zustimmung durch den Aufsichtsrat.

Die strategische Ausrichtung des Unternehmens stimmt der Vorstand mit dem Aufsichtsrat ab und setzt sie verantwortlich um. Der Vorstand achtet darauf, dass die im Unternehmen eingesetzten Instrumente effektiv und effizient sind. Ziele von Wincor Nixdorf sind, die Kunden besser als der Wettbewerb zu bedienen und den Unternehmenswert nachhaltig zu steigern. Die Planungs-, Kontroll- und Risikomanagementsysteme haben deshalb einen hohen Stellenwert in der Unternehmensführung. Mit diesen Instrumenten wird das Unternehmen gesteuert.

Der Vorstand informiert den Aufsichtsrat regelmäßig, zeitnah und umfassend über alle relevanten Fragen der Planung, Geschäftsentwicklung und Risikosituation. Abweichungen in der Planung oder bei den festgelegten Zielen werden dem Aufsichtsrat berichtet und erläutert.